Criado para preservar e dar acesso ao acervo especial de Obras Raras da Fiocruz, é constituído com um material diversificado e selecionado de acordo com critérios de seleção como raridade e preciosidade. Entre as obras mais antigas do acervo, encontra-se o primeiro tratado sobre História Natural do Brasil, denominado Historia Naturalis Brasiliae (1648), e a tese de doutorado de Oswaldo Cruz.
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